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97 changes: 95 additions & 2 deletions plans/DECLARED-REVISION.txt
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -1761,5 +1761,98 @@
# la unidad se queda enmascarada en su maquina, no aqui.
#
# ---------------------------------------------------------------------------
coordinator 3794d31e33a3028af46947ff81720bf2a417c2f3
schema-applied 3794d31e33a3028af46947ff81720bf2a417c2f3
#
# 2026-11-03, segundo salto de la noche. El arbol servido sube a 1766b8a y
# schema-applied se mueve con el, porque esta vez hay migracion.
#
# QUE LLEVA, un commit: PROTEA#1088, ADR-D51, los codigos por residuo de un
# vocabulario congelado. 23 ficheros, +2310/-12. Tres operaciones nuevas en el
# catalogo: el coordinador encode_residue_vocabulary, su lote de tarjeta, y
# store_residue_codes.
#
# LA MIGRACION, y esta linea es una afirmacion y no una intencion. e3c9a7f15b20
# sobre d5a1c8e3f706, 94 a 95 ficheros en alembic/versions. Aplicada en este
# servidor ANTES de escribir esto, desde un worktree en 1766b8a para no mover el
# arbol servido antes que la declaracion, y comprobada LEYENDO LA BASE y no la
# palabra de alembic:
#
# alembic_version e3c9a7f15b20
# residue_code existe, 9 columnas, 0 filas
# indices ix_..._sequence_id, ix_..._embedding_config_id,
# ix_..._shard_key, residue_code_pkey
# unico uq_residue_code_sequence_config
#
# El ensayo en seco de alembic dio exactamente una CREATE TABLE, tres indices y
# el UPDATE de alembic_version dentro de una transaccion. Nada mas.
#
# EL PIN DE protea-backends SUBE A 370f904, Y NO ES LA PUNTA DE develop. Es
# 9b76719 -- lo que este servidor ya corria -- mas un solo commit, el camino
# exacto por capas de #46. Verificado contra el repositorio y no contra el
# resumen de nadie: un unico padre, 9b76719; ahead=1 behind=0; y tres ficheros
# con CERO borrados, ankh/__init__.py +53/-0, ankh/exact.py y
# tests/test_ankh_exact.py nuevos. El metodo nuevo importa su modulo de forma
# diferida y lo unico que toca del modelo cargado es un atributo
# _protea_exact_ankh que nadie mas lee: ExactAnkh.__init__ solo LEE el encoder,
# la tabla de sesgo y las dimensiones, asi que embed_batch_per_residue no se
# contamina en el mismo proceso.
#
# EL VENV DE ESTE SERVIDOR SE REINSTALO ANTES DE ESCRIBIR ESTO, como pide la
# cabecera de este fichero, y hay una trampa que conviene dejar escrita: el
# primer `pip install --no-deps` del commit nuevo devolvio exit 0 y NO CAMBIO
# NADA, porque pip vio la misma version 0.1.0 ya instalada y se la salto. El
# codigo de salida no era la senal. La senal es
# site-packages/protea_backends-*.dist-info/direct_url.json, que seguia diciendo
# 9b76719. Con --force-reinstall --no-deps dice ya 370f904, torch sigue en
# 2.12.0+cpu y pip check esta limpio.
#
# POR QUE NO LA PUNTA, Y QUE CUESTA LLEGAR A ELLA. La punta 86e8260 lleva ademas
# #44 y #45. Reproducido aqui inyectando la punta por PYTHONPATH sobre el venv
# servido, sin tocarlo: cinco tests de PROTEA caen, en dos clases.
#
# #45 cambio tokenizer.batch_encode_plus(...) por tokenizer(...). Los dobles
# que solo definen batch_encode_plus dan KeyError 'input_ids' en
# t5/__init__.py:390. Eso si es un doble que hay que adaptar.
#
# #44 anade embed_chunks_multi, y eso NO es un doble caduco: es una costura
# que se mueve con el pin. shared_pass_emitter lo encuentra por getattr, asi
# que compute_embeddings.py:594 toma la ruta compartida y tres tests que
# parchean op._embed_batch dejan de interceptar y conducen el backend real con
# MagicMocks: ValueError invalid layer_indices, rango valido 0..-1. La
# docstring de compute_embeddings.py:590 promete que
# patch.object(op, "_embed_batch") cubre tambien la ruta de grupo, y esa
# promesa solo se cumple en la rama de reserva. Hoy se sostiene unicamente
# porque el backend pinchado no tiene el metodo.
#
# La subida a la punta, con #44, #45 y esas costuras arregladas, queda como
# despliegue aparte y es mio. No entra aqui para no meter dos cambios ajenos
# dentro de este.
#
# LA BASE LA ESCRIBE EL SERVIDOR Y NO LA TARJETA. store_residue_codes corre en
# protea.embeddings.write: el lote de tarjeta sube un fragmento comprimido al
# almacen y publica el mensaje pequeno; esta etapa comprueba el sha256, exige
# que el mensaje y el fragmento coincidan en configuracion, en numero y en cada
# posicion con sus dos contadores, inserta con on_conflict_do_nothing y avanza
# el padre. Un lote que no llegue no deja fila ni estado parcial, asi que
# relanzar el coordinador despacha solo las secuencias sin fila.
#
# LO QUE HAY QUE VIGILAR DURANTE EL RUN, y no es el estado del job. Si un
# fragmento falla la verificacion la excepcion sale de execute, el lote se
# nackea sin reencolar y acaba en protea.dead-letter MIENTRAS EL PADRE SIGUE
# RUNNING SIN ERROR. La senal de perdida es el delta de esa cola, que arranca en
# 18.775.
#
# PUERTA COMPROBADA ANTES DE DECLARAR: 0 jobs en QUEUED o RUNNING, y ninguna
# cola de trabajo con mensajes. protea.dead-letter en 18.775, que son los lotes
# rechazados de cbaba8bb y no trabajo en vuelo.
#
# EL NODO: su temporizador seguira esta ref y su propio vigilante tiene el
# trabajador de lotes parado mientras corren las lecturas del generador sobre la
# tarjeta, asi que el ensayo puede esperar en la cola. El artefacto del
# vocabulario ya esta en el MinIO de este servidor, verificado por la API de S3:
# residue-vocabulary/vocabulary-v1-06fed75ca76d17be.npz, 260.233.730 bytes,
# sha256 06fed75ca76d17bea91639675b607987c43f031f4cdc09bc7442a4a97adeb301, cuyos
# 16 primeros hex SON el nombre de la clave.
#
# ---------------------------------------------------------------------------
coordinator 1766b8a4f50418fdc3cf877dd9bb226e70859051
schema-applied 1766b8a4f50418fdc3cf877dd9bb226e70859051
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